A Kiwayu, che è un'area difficile situata a una lunga distanza dal centro del paese e dalla regione in cui si trova, c'è un aeroporto poco sviluppato. Inoltre, c'è una pista di atterraggio sull'Isola di Kiwayu. Gli abitanti della regione utilizzano l'Aeroporto di Manda situato a Lamu invece dell'aeroporto che organizza voli stagionali solo per Nairobi. Anche se ci sono voli diretti per questo aeroporto solo da Nairobi, ci sono sei diverse compagnie che offrono servizio in questo aeroporto.